דר אבולעפיה עומד בראש המכון ולכן הוא מקים מפגש אבחון ראשוני ובניין תוכנית טיפולית הכולל לפעמים הפניה למטפל מתאים ככל האפשר, תוספים תזונתיים, תמיכה תרופתית זמנית, עצות טבעיות לנפש וכד' לפי הצורך. הוא דוגל בשיטה אינטגרטיבית יהודית כלומר בצורך בשילוב בין כלים שונים להגיע אל נקודת הבריאות והאיזון יחד עם תפיסה אמונית יהודית ברורה.

הוא מאמין בשילוב בין כלים שונים מתוכם הוא מאמין בשימוש בכלים גופנפש, כלומר שהגוף והנפש הם יחידה אחת.
כמו כן, הוא עובד ומפנה למטפלים שמאמינים שהשורש של כל משבר הוא הטוב שממתין לאדם, כלומר שכל ירידה הוא לצורך עליה ועוד תובנות רבות עמוקות שמאפשרות להביא את האדם לריפוי מלא.
כל העקרונות של הטיפול מתוארים בספר 'שובי נפשי' שניתן לרכוש כאן.

בקליניקה נמצאים פסיכותרפיסטים ופסיכולוגים נוספים